西南联合大学在抗战时期由国立北京大学、国立清华大学和私立南开大学三所大学组成，是一所综合性大学。该校的院系设置包括：
文学院：
包括中国文学系、外国文学系、哲学心理学系和历史学系。
理学院：
包含数学系、物理系、化学系等。
法商学院：
设有法律学系、经济学系、商学系等。
工学院：
包括机械工程学系、航空工程学系、土木工程系等。
师范学院：
设有教育学系、公民训育系、国文学系、英语学系、史地系、数学系、理化系等。
这些院系在抗战时期为中国培养了许多杰出人才。西南联合大学的院系设置在国立长沙临时大学原有院系的基础上稍有发展和调整。