截止2024年，新疆昌吉市拥有以下大学：

昌吉学院

昌吉学院是一所区属普通高等学校，其前身是成立于1959年的昌吉师范学校，2001年5月升格为昌吉学院。

新疆农业职业技术学院

新疆农业职业技术学院是一所公办全日制普通高等职业院校，是国家示范性高职院校，也是新疆“高等职业教育与本科教育联合培养应用本科人才”试点高校。

昌吉职业技术学院

昌吉职业技术学院是经国家教育部批准成立的一所公办全日制普通高等职业院校，是新疆首批“示范性高职院校”。

新疆医科大学昌吉校区

新疆医科大学昌吉校区是新疆医科大学的一个校区，提供本科和研究生课程。

建议：

昌吉学院作为区属本科院校，具有较高的教育质量和学术水平，适合追求学术发展的学生。

新疆农业职业技术学院和 昌吉职业技术学院作为高职院校，注重职业技能培养，适合希望就业于相关行业的学生。

新疆医科大学昌吉校区作为医学专业的校区，适合有志于从事医学工作的学生。