制药工程是一个涉及多个学科的领域，本科阶段的主要课程通常包括：
基础科学课程
高等数学
大学物理
有机化学
无机化学
分析化学等
制药工程基础课程
制药工程原理
制药工艺学
制药设备与工艺
制药工程自动化等
制剂学
药物制剂学
药物包装与储存
药物分析等
药物化学
药物合成
药物分析
药物代谢等
生物制药
生物工程原理
发酵工程
生物制药工艺等
药物动力学
研究药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄过程，以及药物的药效学和毒理学
其他相关课程
天然药物化学
应用光谱解析
制药高分子材料
制药分离工程
药物装备与车间设计
药事管理学
药品营销等
对于中药制药学科，还可能包括以下课程：
药用植物学
中药学
方剂学
中药化学
中药药剂学
中药制剂分析
中药药理学
中药炮制学
中药制剂分析等
农药制药工程学科则可能包括：
植物学
农药学
这些课程共同构成了制药工程专业的知识体系，旨在培养具备制药生产、研发、管理等方面能力的专业人才。建议学生在选择制药工程相关专业时，详细了解各课程内容，以便更好地规划自己的学习路径。